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La Unidad Académica de Ecología Marina, sede del posgrado cuenta con una biblioteca compartida con la licenciatura que cuenta con más de 1000 volúmenes. Dicha biblioteca cuenta con títulos especializados en el área de Ecología Marina así como revistas especializadas. Así mismo, los centros de adscripción de profesores participantes del NAB y de medio tiempo, cuentan también con bibliotecas con títulos especializados en su Línea de Generación y Aplicación del Conocimiento. De manera institucional, el posgrado tiene acceso a la base de datos de la Biblioteca Virtual de la UAGro, la cual tiene acceso en línea a libros especializados de las principales casas editoriales del mundo así como a un número importante de revistas científicas. Finalmente, la institución cuenta con acceso a la base de datos del CONRICYT, la cual cuenta con acceso a las revistas especializadas más importantes del mundo.